海口港位于海南島北岸中部的海口灣和澄邁灣內，港口西起澄邁灣的玉包角，東至鋪前灣的北港島，北隔瓊州海峽與雷州半島相望。東距鋪前港23海里，北距海安港17海里，西距洋浦港89海里，西北距北海港134海里，是海南島與大陸之間的水上交通樞紐和島內各種生產和生活物資的集散地。

海口港素有“瓊州門戶”之稱，擁有海岸線長達82．3千米，現劃分為3個港區，分別是秀英港區、新海港區和馬村港區。各港區都已對外開放，具有完備的港口設施、設備。

秀英港區為海口港的主港區，位于瓊州海峽南側的海口灣內，海口市秀英區北側，南渡江支流海甸河入海口西南方。秀英港區由南、北兩個港池構成。南面港池由陸岸（1號-8號泊位）、第二作業區碼頭（9號-11號泊位）及北岸碼頭（12號-14號泊位、海事局碼頭）圍成，東西長約700米，南北寬約300米，水深3．5米～8米；北面港池由海事局碼頭、救助局碼頭、第三作業區萬噸級泊位（17號-18號泊位）及其北側二期工程5萬噸級集裝箱碼頭組成，港池寬約600米，水深6米～13．2米，由一條長約900米、深約9米的疏浚航道與主航道相連。

秀英港區附近陸岸地勢較為平緩，起伏不大無顯著的自然導航目標，但人工助航設施完備，船舶可晝夜通航。港區避風條件較差，在臺風來臨時，大型船舶可在港外水深12米～20米水域分散錨泊防風，一般船舶多前往流沙港或鋪前港避風。海口港二期工程已全部交工驗收，目前秀英港區主要以集裝箱、商品汽車滾裝運輸和客運為主，兼顧大型郵輪停靠，并逐步發展成為國際國內客運基地。港區貨物年設計通過能力為件雜貨272萬噸、集裝箱60萬標準箱、滾裝車輛65萬輛。實際年通過能力為散雜貨約406萬噸、集裝箱約80萬標準箱、旅客約563萬人次、滾裝汽車約100萬輛。

新海港區位于海口市新海鄉新海村西側，俗稱 “天尾角”的西南側，北隔瓊州海峽與雷州半島相望，陸路距海口市21千米，地理坐標為20°02′．6N、110°08′．9E。港區南起粵海鐵路通道南港火車輪渡碼頭南防波堤根部外側，北至規劃汽車滾裝碼頭作業區北防波堤外側，后方緊鄰濱海大道，岸線長2．38千米，陸域面積3．22平方千米。水域規劃港區界線由以下5點連線而成：

（1）20°02＇22＂．2N、110°08＇51＂．0E；

（2）20°02＇15＂．3N、110°08＇15＂．4E；

（3）20°02＇21＂．4N、110°07＇30＂．5E；

（4）20°03＇38＂．7N、110°07＇52＂．5E；

（5）20°03＇44＂．4N、110°09＇40＂．1E。

該港區是火車輪渡和客貨汽車滾裝運輸的專用作業區，也是海南省與大陸之間陸島運輸及海南省生活物資集散和配送服務的主要港區。現有海鐵路南港碼頭和汽車滾裝碼頭。其中南港碼頭港池水深6．5米。汽車滾裝碼頭航道及掉頭區水深5．6米，港池水深6．9米。

馬村港區位于海口港秀英港區西側的澄邁灣西南部，距秀英港區約25海里。西起玉包角，東至美當灣的東灣口，岸線長20千米，最大陸域縱深2，8千米，規劃陸域面積約26．6平方千米。水域規劃港區界線由以下4點連線而成：

（1）19°59＇36＂．0N、109°56＇22＂．0E；

（2）20°02＇42＂．9N、110°00＇39＂．3E；

（3）20°02＇42＂．3N、110°06＇27＂．9E；

（4）19°59＇45＂．7N、110°07＇06＂．5E。

該港區是海口港的綜合性港區，主要承擔集裝箱運輸、油品、散雜貨及危險品運輸。建有5座碼頭，共7個泊位，大部分為業主碼頭，以危險品作業為主，也是海南島目前最大的危險品作業港區。

海口港既是海南省對外貿易的重要口岸，又是旅客進出海南省的重要通道。開通了與海安、北海、湛江、深圳、廣州等地的汽車、旅客滾裝輪航班；海口至海安的火車輪渡；海口至廣州、湛江北海的國內集裝箱航線。并與日本、朝鮮、馬來西亞、新加坡、泰國、印尼、科威特、沙特阿拉伯等多個國家和地區有貿易往來。