蘇州港位于長江下游，共有3個港區，分別為張家港港區、常熟港區和太倉港區，其中張家港港區為蘇州港主港區。

張家港港區位于我國黃金水道長江下游南岸張家港市境內，地理位置優越，水路交通發達，自然條件優越，腹地經濟實力雄厚。港口后枕京滬鐵路，沿江高速公路橫亙東西，錫澄高速公路和204國道縱貫南北，江陰和蘇通長江大橋連接蘇南、蘇北。距港口僅57千米的無錫和常州還建有碩放和奔牛機場，有便捷的空中運輸。水路更是四通八達：西沿長江而上，距南京222千米；東順長江而下，距上海吳淞口約130千米；內河距蘇州105千米，無錫73.5千米，常州105.5千米；向北經通揚運河可通蘇北內河網，向南通過巫山港船閘經京杭運河及太湖水系，貫通蘇南，并與上海和浙江的杭、嘉、甬地區相連。港口不僅有先進的通訊導航系統，還建有完善的船舶交通管理系統（VTS）、船舶自動識別系統（AIS）、電視監控系統（CCTV）等監控系統。張家港港區年貨物吞吐量超億噸，為江蘇省南部蘇州、無錫、常州三市對外貿易的重要口岸。

常熟港區位于長江下游白茆沙水道南岸，江蘇省東南部常熟市境內，離長江口100千米，至常熟市區20千米。1996年11月16日被批準為對外開放港口。常熟港區以外貿、能源、建材、紙漿裝卸為主專業碼頭和貨主碼頭并重，是功能比較齊全的綜合型港口。

太倉港區位于江蘇省東南端，地處長江流域與東部沿海的交匯附近，明代著名的航海家鄭和七下西洋均從這里起錨揚帆。其東臨上海，港口腹地為我國經濟發展最快的蘇、錫、常地區，是長江經濟帶與東部沿海經濟帶的“T”形交匯處，擁有長江岸線38.8千米，其中深水岸線25.7千米。1996年11月太倉港區作為國家一類口岸正式對外開放。太倉港區是上海、蘇州經濟區重要的石油化工品、集裝箱、件雜貨、木材集散地，也是上海市化工品唯一的國際水路中轉站，水陸交通便利，中轉貨物運輸覆蓋滬浙蘇地區。目前港口接卸貨物主要有石油制品、化工原料、煤炭、集裝箱、原木、卷鋼等。